Dr. Otmar Stöcker ist seit 2001 Geschäftsführer und seit 2014 zusätzlich Leiter des Bereiches „Deckungswerte“ im Verband deutscher Pfandbriefbanken (vdp), für den er seit 1989 tätig ist. Von 1997 bis 2007 hat er dessen Bereich „Pfandbriefgesetz, Internationales Geschäft“ geleitet. Er verantwortet die Koordinierung der vdp-Tätigkeiten zur Auslegung des Pfandbriefgesetzes und dessen Weiterentwicklung. Dr. Otmar Stöcker leitet die beiden Research-Projekte „Runder Tisch Grundpfandrechte“ und „Round Table Covered Bond Legislation“.

In mehreren Monographien (u.a. Die Eurohypothek) und zahlreichen Fachaufsätzen hat er sich intensiv mit dem Hypothekenrecht und dem Recht der Covered Bonds in Europa auseinandergesetzt.